二戰末期，日軍在太平洋戰場節節敗退。隨著戰爭形勢的逆轉，美軍在麥克阿瑟的領導下，開始反攻菲律賓。

1945年2月，日軍下令將馬尼拉設爲不設防城市，但日本海軍部隊拒絕服從命令，並在首都馬尼拉進行了大規模的大屠殺，包括對菲律賓平民和戰俘的射殺、焚燒、毒氣和任意處決等。據曆史記載，馬尼拉大約有四分之三的建築被毀，約12萬5千名菲律賓人在這場大屠殺中喪生。

在屠殺過程中，日軍使用了各種暴力和恐怖的手段。

日軍在馬尼拉的街頭隨意射殺、焚燒並處決無辜的菲律賓平民，尤其對醫生、律師和教師等職業人士極度仇恨，認爲他們是反抗日本統治的領導者。

日軍將平民和戰俘聚集起來，進行殘忍的虐待和折磨，最後用手榴彈或機關槍掃射進行集體屠殺。

日軍還對菲律賓婦女和少女進行了大規模的強X和X暴力，大量受害者因此殘疾、懷孕或死亡。甚至菲律賓總統的妻女，也被日軍瘋狂折磨後殘忍殺害。

最終，約12.5萬名菲律賓人在這場大屠殺中喪生。直到1945年2月23日，美軍解放馬尼拉後，才結束了這場悲劇。

馬尼拉大屠殺是二戰期間日軍在亞洲戰場犯下的衆多暴行之一，其殘忍程度和規模令人震驚。日軍對無辜平民的肆意屠殺、對婦女兒童的殘忍對待，都顯示出他們喪失了基本的人性和道德底線。

這場災難引起了國際社會的廣泛關注，各國政府和國際組織紛紛發表聲明，譴責日軍的暴行，並呼籲追究戰爭罪犯的責任。