上部金剛只是回到地心空洞，還沒開始探索老家世界的環境，就被再次召喚到地上世界去戰鬥了。
這部緊接著上部的故事展開，開頭用了點時間，展示金剛在地心空洞探索，還翻倍其他物種給當成獵物獵殺，畢竟來到這裏有好幾年了，所以布局一些陷阱（地面、上空、地下都設計到有）以方便遇到比自己強大的對手或者一群對手，到時打不過，就可以引到自己的領地（它選的這個領地，傍著一個懸崖，還是有點聰明，會看地形），用陷進的當幫手。只是有點遺憾的是，還沒發現到自己同種族的物種。
這次遇到的對手就比較強大，看起來像是類似于狼的一群，好幾十只把金剛當獵物。估計設計好的陷進，也是這次才算用上。恰好就這次用上了，用到的是地下的，估計是因爲獵物掉下去被樹尖刺穿，但因爲速度太快，還沒有立馬死，就會用余力使勁反抗，導致把更下面的地弄開了一條裂縫，這裂縫就導致了本片的故事展開。
只是當時金剛沒那麽多，尤其是牙痛，可能在地心經常打架，或者吃的了啥不健康的，弄得一顆左邊門牙很痛，就想起了人類朋友，就去找到地心與地上連著的一個漩渦爬上來求救。
人類這邊不知道情況，還以爲發生了大事。當然是發生了大事。
這大事引起了兩邊的關注。
一邊是哥斯拉，感受到了能量異常，甚至感覺敵人可能很強大，所以主動發起了進攻，去找那些泰坦巨獸，估計是那種平時不出來搞事的，它這次主動出擊，爲了是吸取它們的能量，爲接下裏的戰鬥做准備。還沒感應到能力波動前，先在羅馬打了一架，類似于蜘蛛的怪獸，但是腿要少些，就4-6條的樣子，估計這部分是因爲片方要照顧哥斯拉的戲份。過後才感應到地心有新異常，才開始去吸取能量，先去的法國一個核基地，把該基地的核能全吸了，在去的北極，北冰洋哪裏，電影裏邊解說的是，存儲了大量能量，當然也有怪獸在哪裏，那怪獸叫提亞瑪特，被搞得個分屍，最後到它基地老窩裏邊，把多年積累的能量，全吸了，片中說是哥斯拉比原有能量多了近20倍。
一邊是人類這邊，主要是那股力量召喚的上部的小啞巴，這部大了幾歲，是吉雅。她在上學的時候，收到這個信號的時候，導致不知東南西北，在課堂練習本上鬼畫桃符，讓老師很不滿，把她幹媽安德魯斯找來。幹媽其實那邊工作也收到信號，把設備都搞得失靈了，也畫出來不少信號波段在紙上表現出來。因爲看不動，就聯想到了上部那個做直播，對哥斯拉金剛很關注的業外人士，是個黑人，想問問他的意見。你別說，這人還真有點東西。他一大願望就是因爲近距離接觸下金剛，結果因爲上部，他拯救世界的事情，沒人知道，因爲組織不認可他的功勞，弄得他的粉絲都以爲他是騙子，還掉了不少粉絲了。這次好不容易遇到個機會，那肯定一方面要證明自己不是騙子，一方面也是真的對金剛哥斯拉這些怪獸，要近距離看看。安德魯斯也不好拒絕，只好答應了。
金剛來到地上後，組織這邊安排了一個牙醫給它修，先是把壞牙給拔掉，然後換上了一個高科技的牙齒，堅硬程度，能把埃菲爾鐵塔咬碎。
換好了後，金剛要回地心，人類這邊幾個，也要去看看地心是那個位置出現了能量波動，得找到源頭，去了五個人，一個司機，母女，牙醫，主播，其實有三個都不需要去的，但是劇情需要，你懂的，就是吉雅、牙醫、主播都可以不去的，反正編劇找些理由，得安排過去。
金剛回去後，也發現不對勁了，就是那陷進位置，下面似乎顯示出了亮光。就先下去了。下去後，原來是別有洞天，算是二層地心了，會不會有第三層呢？下來後，有個迷你金剛，這家夥開始對金剛是抱著敵意的，附近還有幾個大的金剛族人，只是不懷好意，跟金剛大戰一場都輸了，有些掉到新的地下，有跑路了。那迷你金剛，看它的眼睛和臉色，好像是在思考什麽，想起來有個水怪可能能幹翻金剛，就帶著去了。到了地方，先假裝在河裏清潔臉面再補點水，讓金剛也這樣，其實是爲了引來大水怪，算是大蟒蛇那類，也可以叫龍吧，但是超大超長。
這些怪物都有領地意識，一旦遇到有威脅的對手過來，就會很敏感，會對對方宣戰。大水蛇跟金剛打了起來，迷你金剛偷笑，當然也可以乘它們打架，自己不用被金剛盯著，方便跑路，是沒多久，就被金剛幹掉了。金剛對這小家夥算是不錯的了，知道它故意帶過來打架，還好心分水蛇肉給它吃。
金剛來這下面肯定不是爲了吃肉的，還得讓向導，就是熟悉二層地心的迷你金剛帶路到主要目的地去。到了後，非常的震撼，這裏算是很惡劣的地方了吧，那種到處都是火泥石流，還很多族類在哪裏幹著西西弗斯的活，不知道在哪裏搬石頭幹啥，有啥用處呢？還沒震撼完，就被裏邊的一些保安看著了，看著外人來了，似乎跟自己不是一夥的，得把自己的職責執行起來，不管三七二十一，先打了再說，只是沒打贏，似乎是個高手，打不過就的搬救兵了，不遠處的洞裏，似乎有更牛逼的老大哦！
吉雅這邊五人沒跟著金剛走，而是去了一個什麽基地的，算是個前哨，離地上地下漩渦進出口，大概100公裏的地方，到了後發現，被毀了，難怪很多信號都收不到了。然後就繼續往前探索，沒多遠，就讓吉雅覺得，那股能量越來越強了，似乎就在那邊的，能肉眼看到的一座大山的某個垭口。可能是地飛不方便直接過去，而是離那位置幾公裏的地方停下來，全部步行過去。這段距離裏邊，就犧牲了那個司機，被一個矮樹，不到一個成人高的，給吃了，還把持有的機槍給吐了出來，看來那樹甯願吃人骨，都不愛吃工業機器産品。
吉雅們到了目的地後，發現這裏居然有房屋建築遺址，簡直是超級大發現，這地心居然有人，還搞了這麽大的建築遺址，據安德魯斯分析，這些遺址比骷髅島的伊維族建築還要早幾個世紀。差不多走到頂了，吉雅看到這些同類的建築物，還是有心靈感應的，那位置的右邊有一堵牆，那牆上有個類似蝴蝶的圖騰相，安德魯斯脫口而出，說是怪物女王摩斯拉。吉雅再仔細看的時候，發現有個按鈕，就去啓動了。周邊的那些規則的，看起來像八卦陣那種，有很多凹槽，裏邊居然通水了，而且一路沿著下方的槽子一路奔去，吉雅們就跟著水流方向跑去，直到跑到一個類似于實物結界的地方，還以爲過不去了，但被牙醫觀察的時候，發現水還在繼續往槽子溜過去，一模那結界，似乎有反應，不斷的放出銀光。
吉雅就更大膽子，試著雙手去撕開結界，被強光找過來，真的快把眼睛給弄瞎了，等眼睛適應後，發現是一個洞天，遠處有兩個鑽石金字塔，非常大的那種，一個在下面，一個在上面不過是倒立的，但兩座中間有一段距離，並沒有接觸上，周邊還有不少亮晶晶的有形狀的晶體，也就是能量石，另外還有幾個漩渦，意思就是這些漩渦都可以到地上的入口。
四人穿過後，走了一段路程，被牙醫感覺不舒服，總覺得有人跟著，還真感覺對了，很快就四人就被一些看起來是土族人的人，給制服了。把四人帶到能量石那邊，被當成犯人似的，等著族人領袖，伊維女王，陳法拉演的，出來看怎麽行刑。女王肯定是能感受到族人的，就是能感覺到吉雅是同類人，因爲都可以靠心靈感應知道對方的想法，只是另外三個人，就不知道了。所以召喚吉雅過去，兩人雙手接觸，就可以深度感應了，女王通過吉雅的手，可以穿透吉雅的記憶去觀察另外三人跟她的關系，是敵是友，感應完了後，就放了另外三人，還帶他們到伊維族的史室，就是以前他們族人留下的資料，可能是沒文字吧，但是留下了圖，把那間密室從地下到周邊牆壁都做滿了圖案。這些圖案，安德魯斯都可以解讀。
她說解釋給另外兩個人類聽，也是在告訴觀衆聽，這些內容是啥意思。說是地心世界和地上時間，原本是有溝通的，金剛族甚至是人類的保護者，只是裏邊出現了一個壞的家夥，叫刀疤王，它很想做金剛族的王，還要占領地上世界，就導致了大戰，一方面跟金剛正義的打；一方面地上的打，遇到地上怪獸之王哥斯拉，這家夥就是保護地上生態的，尤其不喜歡帶特異能量的侵入者，其實還有一個就是伊維族的怪獸女王摩斯拉，最後就是哥斯拉和摩斯拉一起擊退了刀疤，不知道爲什麽沒弄死它，只是把它和那些對手，都關在二層地心，就是那位置有很多火流的地方。因爲這次大戰，就導致了地上和地下斷了聯系。
預言還繼續說，因爲金剛要是回到地心，就會引起再度戰役，可能導致末日，要阻止末日的話，就需要一個外來伊維族的人，尤其是骷髅島來的伊維族人，來啓動閉關的怪獸女王魔斯拉，讓它去跟哥斯拉溝通，因爲它們曾經是盟友，一起去對抗敵人。這次那刀疤還降服了一個遠古猛獸，叫雪魔，至于怎麽降服的，沒具體展示，只是提供了一個控制的設備，看起來像個能量石打造的尖錐物件，似乎這玩意能讓雪魔産生痛苦，受不了，就只能求饒，也只能跟著刀疤混了。
就是因爲感覺到這個預言快要到了，伊維族人才通過他們的能量石，往地上發出信號，一方面是求救，一方面也算是尋找那個在外面的伊維族人。
在回過來繼續看，金剛那邊的戰鬥，還沒有結束，剛看到了那裏的領袖，剛才沒說名字，現在不說也應該知道了吧，就是刀疤王。刀疤王挺自負的，就跟金剛直接打起來了，過了幾招，發現這家夥本事不小，要贏的話，估計自己也要輸八百的力氣，不如讓那雪魔來幹掉，自己輕松省事。雪魔的技能實在太厲害，口吐冰能起息，能把附近的各種植物動物都給動起來，金剛就被它的技能給凍傷了。那迷你金剛這時候不知道爲什麽變好人了，還給金剛指路，讓它先跑了，君子報仇十年不晚。跑了再說。刀疤王哪裏會讓你這麽輕松跑了？立馬派人了幾個去追。
金剛是往自己的領地巢穴跑的，因爲那附近還有設計的陷進沒用完，就想把這些追兵引導哪裏去弄死。倒是用了一次，第二次差點沒用上，居然被它們發現了，還好，那迷你金剛一直跟著的，居然看到了這些陷進，就去把第二個給用上了，算是救了金剛一命。兩個看到沒人追來了，就往其他方向跑了，應該是金剛感覺到了吉雅的氣息，就沿著這氣息一路找來。
本來吉雅們剛跟伊維族人熟悉，雖然也在緊張的准備著戰鬥，但也利用空隙在嬉戲。就在這時候，他們感應到有入侵者，伊維族人去啓動機關打開那結界，居然是金剛和迷你金剛，後面還有一個跟著來的追兵看到這個結界內的世界，立馬跑回去通知刀疤。
金剛和吉雅溝通了，金剛覺得自己沒家了，因爲剛才跟刀疤決鬥的時候，被嘲笑了人工牙齒，覺得自己被金剛族人不認可，而且還被它們那麽大圍剿，覺得自己還是孤身一人，更加上剛被雪魔凍壞的右手，戰鬥力也沒了，在這種叢林法則世界，怕是很難活過一天了。
牙醫又派上了用場，真的是全能啊，啥都會，還要特別提的地方是，這家夥主打場面的時候，畫風會不一樣，主要是配樂，會有一種複古的帶搞笑色彩的，讓人忍俊不禁。想到了組織曾經搞了一個項目，因爲第一部裏邊的機械哥斯拉，人類想著幫守護者金剛提高戰鬥力，搞了一個高科技的外置裝備，只是最後項目放棄了，還好的就是，已經弄好的測試裝備恰好就在那個前哨站的武器庫裏邊。當然要救凍傷的金剛右臂，不是撞上機械臂就行的，還得加入一些什麽藥物，反正是有的，先撞上機械臂，然後在打入了什麽藥液啥的，沒幾分鍾，金剛就恢複不少體力和信心，還對機械臂更是興奮，感覺是這玩意能對抗雪魔的冷凍攻擊，所以異常高興。
金剛恢複後，感覺到能繼續戰鬥，就想去找刀疤和雪魔複仇的時候，吉雅給它打手勢，說這邊需要你的幫助，金剛腦子轉換也是很快的，立馬想到了哥斯拉。就往那幾個漩渦的地方奔去，那幾個漩渦是在上面岩壁，金剛要先爬上去，然後倒著跳下去，上來地面的時候，位置實在埃及開羅金字塔附近，當時的哥斯拉是在地中海和大西洋的海峽口，靠北面的直布羅陀，感應到能量異動，就跟著趕過來了。
看到哥斯拉來了，金剛一直給它暗示，讓它去那個漩渦，但哥斯拉似乎不懂它的意思，直接開始打，金剛躲避了幾下。幫金剛裝機械臂的時候，吉雅那邊被伊維女王帶著去喚醒摩斯拉。摩斯拉醒來後，就直接往漩渦那邊飛去，幸好兩家夥還沒出現傷亡。摩斯拉的哨聲，可能是一種獨特預言，能讓哥斯拉聽懂。
三大怪獸意思達成一致，就穿過漩渦下到地心。這邊也恰好趕上刀疤和雪魔帶隊的人馬過來。伊維族也不是沒准備，他們打算把那些能量石操控的地心引力反轉，哪怕幾分鍾，只要能延遲被刀疤攻擊，也是極好的。我們人類兄弟呢？不會啥也幫不了吧？也不是哈，又是牙醫，除了她，似乎安德魯斯、主播沒啥用啊，一個是翻譯，一個是記錄，好像戰鬥用不上。牙醫這次想到了一個絕招，就是他們下來的時候，有一段悠閑的旅遊，遇到了很多鳥，這種鳥似乎一般不會主動攻擊的，只是耐不住數量多啊，牙醫對它們似乎是有研究的，能想辦法把一大群都給引過來，也就幸好他這招，給三大怪獸和地心引力反轉，引來了短暫的空隙，不然的話，後果不堪設想。
這刀疤的主要目的是上地面，所以雖然地心引力是反轉了，也打了一些架，其實這場面戲看起來很好看的，看著幾大怪獸都失去重力，在哪裏穿過去打過來的，視效享受絕對是拉滿了。但別忘了刀疤的主要目標還是沒變，它是想方設法的接近漩渦，一旦接近就直沖，穿到地上來，這次地點變了，不是在開羅，是在巴西裏約熱內盧。
等地心引力失效了後，金剛、哥斯拉、雪魔都穿到地上來了，可惜金剛的能量斧子還給拉在了漩渦附近。摩斯拉呢？似乎沒跟上來。
來到地上，先是雪魔發動攻擊，把本來卷起的大浪，全給凍成冰塊了，裏邊有哥斯拉，金剛沒凍到，不敢想，要是給凍著了，那就完蛋了。哥斯拉不怕凍，人家本來就是噴能量的，所以不怕凍。這裏傳出來的鏡頭旋轉180度，要是腦子跟不上，可能覺得是多余，要是跟得上，那會覺得導演很牛逼。
四個怪獸混戰，先是金剛跟刀疤、哥斯拉對戰雪魔，打了幾招，換了對手，金剛對雪魔，哥斯拉對刀疤。這刀疤那能量尖錐似乎對哥斯拉沒用，它弄金剛的時候，還劃傷了幾次，搞哥斯拉，好像就不得行了，弄得最後，套著尖錐的骨鏈都給哥斯拉給扯斷了，這東西斷了，直接把刀疤的功夫給砍掉了一半，戰鬥力就不行了。這邊雪魔還在使勁吹冰塊，金剛有那機械臂擋著，暫時扛得住。在地心的那迷你金剛看到了那能量斧子，曉得是金剛的，沒了這玩意，實力會削弱大半，所以急忙取下來穿過漩渦送給金剛。結果上來看到兩邊都在對抗，尤其是看到刀疤被哥斯拉搞得拿不到那個尖錐，它又剛好拿著能量斧子，就先把尖錐毀了再說，都是能量石打造的，爲什麽金剛的斧子更強呢？因爲它塊頭更大嗎？還是因爲是主動攻擊？反正砸爛了尖錐後，那雪魔似乎表情有點好看。
雪魔似乎一下子神清氣爽，就放棄了跟金剛的打鬥。現在這些是三對一了，哥斯拉、雪魔、金剛都盯著刀疤，感覺不是敵手，要跑的時候，被金剛給抓住了，本來是哥斯拉要吐能力滅它的，似乎哥斯拉能看懂雪魔的意思，就讓雪魔來動手，雪魔朝刀疤噴冷氣把刀疤凍成冰型，然後被金剛砸的稀巴爛。
這次的危機總算解除了，摩斯拉就要繼續沉睡；哥斯拉似乎只有遇到危機才會醒來，解決後，也是繼續沉睡；雪魔感覺也是無親無故的，反正都是跟別人混，不如就跟金剛混了，金剛帶著雪魔去那有火的地下，解放了族人，至于後續怎麽開展故事，就只有期待第三部了。
至于吉雅是要回到族人身邊還是繼續跟幹媽過，這幹媽自以爲是覺得她跟族人過更好，所以在離別的時候，依依不舍。在准備跟吉雅告別的時候，吉雅有點責備的意思吧，爲什麽不問問我的意見呢？光靠自己的腦補。吉雅可不是這麽想的，她還是願意跟幹媽一起過的，不回到族人這邊，可能雖然融入大人類群體，有點困難，但是小群體還是能接受的。爲什麽不願意回族人身邊呢？感覺是看著她們太落後了吧，地上世界都是超級發達了，你們這些族人還在原始部落模式，可能短期能一起玩玩，要時間長了，還是憋不住，畢竟曾經在花花世界見過世面的。
你別說這部電影這次拍的很成功，比我預期強太多了，本來以爲就是怪獸打打，但是看著導演拍攝的畫面、特效、故事，總感覺還是很用心的，尤其看到畫面，有一種很厚重正式的感覺，不像那些胡亂玩玩的態度。當然也不是沒感覺到一些細節的問題，但總覺得整體賞心悅目，小瑕疵就沒必要計較，不過還是要說出來下，到底是哪些小瑕疵，看下部能不能繼續優化。
比如地下的特效部分，主要是設計那些岩石崩裂的，其實已經做到很好了，但還是感覺不夠真實，還可以在優化下；然後就是劇情上，人類真的參與太少了，雖然我知道很多人想看怪獸，不愛看人類的戲份，但是有人類的參與，一定會更好，上部好歹人類搞了個機械哥斯拉，這次人類沒直接參與戰鬥了，有點可惜，難道是後面續集才會參與嗎？那刀疤王的二層地心跟一層地心，是可以上來的，那麽它爲什麽沒上來呢？在等啥？還有就是爲什麽以前哥斯拉和摩斯拉一起不弄死它呢？只是類似于流放的模式，這次爲什麽又可以殺死它了？好奇怪啊！這麽大組織居然不是聯合國控制的，還說什麽各國政府和大企業都想來參與，遇到這種大事，這組織是多強大，能阻止他們的幹預呢？進入查探的時候，都不帶幾個保安，有點無語。
還有不是說哥斯拉能量變強了20倍嗎？怎麽在戰鬥的時候，沒感覺出來，那這個升級的意義在哪裏？我倒想這樣解釋，就是能量大了20倍，只是每次攻擊的時候，吐出來的能量石一定的？所以即使有20倍能量，也不能一下子吐光。只提高了能量，並沒有提高防禦能力，就是皮還是跟以前一樣厚，所以難怪會被金剛、刀疤都打翻在地，所以這多了的能量，只是代表能抗揍而已，等于以前能扛打10分鍾，現在能扛200分鍾。
